Фамилия Фомыгина — женская форма, а её основа — мужская фамилия Фомыгин. Это классическая русская фамилия, образованная по патронимической модели: от личного имени или прозвища с помощью суффикса -ин. В данном случае исходным словом стало «Фомыга» — производная форма от канонического крестильного имени Фома.

Имя Фома (от арамейского «близнец») было широко распространено на Руси, особенно в крестьянской и купеческой среде. От него образовалось множество обиходных, уменьшительных и пренебрежительных форм: Фомка, Фомушка, Фомик, а также Фомыга. Суффикс -ыга в русских прозвищах и именах часто придавал слову разговорный, а иногда и сниженный оттенок (сравните: «Ванька» и «Ваньчуг» или «Серёга»). Соответственно, Фомыгой могли называть человека по имени Фома — либо в дружеском ключе, либо с оттенком фамильярности.

Таким образом, фамилия Фомыгин (и Фомыгина) в основе своей означает «чей-то сын» или «чей-то человек»: буквально — «сын Фомыги». Это типичная «семейная» фамилия, которая закрепилась за потомками того самого Фомыги. В сословном отношении она, скорее всего, принадлежала крестьянам или мещанам — дворянские фамилии чаще образовывались от полных форм имени или через суффикс -ский.

Интересно, что фамилия Фомыгина встречается относительно редко, и её географическое распространение может быть локальным. В отличие от массовых Фоминых или Фомкиных, форма с суффиксом -ыгин указывает на более специфическую, возможно, диалектную или региональную традицию имяобразования. В ономастических словарях (например, в работах В.А. Никонова) подобные модели описаны как характерные для северных и центральных губерний России, где прозвищные имена на -ыга были особенно употребительны. Поэтому, если искать корни фамилии Фомыгина, стоит обратить внимание на исторические записи по Владимирской, Костромской или Вятской губерниям.