Фамилия Фрайвергер — одна из тех, что не встречается в русских документах XVII–XVIII веков, а значит, её происхождение стоит искать в немецком или австрийском языковом ареале. Она составная: первая часть «Фрай-» восходит к немецкому frei — «свободный», а вторая «-вергер» — к bergen, что в одном из значений означает «хранить, укрывать, спасать». Буквально: «тот, кто свободно хранит» или «свободный хранитель». Однако есть и более конкретная версия.

Скорее всего, фамилия образована от названия профессии или статуса. В средневековых немецких землях существовало слово Freiberger — житель города Фрайберг (Саксония) или человек, имевший право на свободное пользование горными разработками (Berg — гора, рудник). Но в варианте Фрайвергер ударение смещается на вторую часть, и здесь возможна связь с глаголом verbergen — «прятать, укрывать». Тогда прозвище могло относиться к человеку, который давал убежище, например, содержал постоялый двор или укрывал беглых.

В пользу немецкого корня говорит и типичный для немецких фамилий суффикс -er, указывающий на деятеля. В отличие от славянских моделей, где фамилии часто оканчиваются на -ов или -ин, Фрайвергер сохраняет исходную германскую структуру без русификации. Встречается она в основном у потомков немецких колонистов, переселившихся в Российскую империю в XVIII–XIX веках, особенно в Поволжье и на юге Украины. Там такие фамилии нередко адаптировали на письме, но звучание оставалось близким к оригиналу.

Спорных версий немного. Иногда пытаются вывести фамилию из еврейского идиша, где fray означает «свободный», а berg — «гора», но это слишком буквально и не подтверждается документальными источниками. Правдоподобнее всего — профессиональное или топонимическое происхождение от названия места или занятия, связанного с горным делом или правом убежища.