Фамилия Футера — редкий случай, когда неясно даже, с какого языка читать исходное слово. Она звучит неестественно для восточнославянского уха: в ней нет привычного суффикса (-ов, -ин, -ский), а окончание -а наводит на мысль, что перед нами не русская, а, скорее, украинская, белорусская или польская форма. Но и там фамилия Футера почти не встречается.

Самая вероятная версия отталкивается от немецкого или идишского корня «Futer» (футер) — подкладка, меховая опушка, а в ремесленном контексте — скорняк или меховщик. В среде еврейских переселенцев, осевших на юго-западе Российской империи, прозвище Футер могло закрепиться за человеком, который торговал мехом или шил шубы. Окончание -а в таком случае — это украинская или польская огласовка (сравните: портной — Швец, но фамилия Швеца). То есть Футера — это «сын Футера» или «из семьи Футеров», где исходное прозвище уже было немецким.

Есть и более прозаичная гипотеза: в некоторых южнорусских говорах «футер» — искажённое «фурьер» (солдат, ведающий продовольствием и расквартированием). Но это сомнительно: слово «фурьер» дало фамилию Фурьер, а не Футера. Скорее всего, перед нами фамилия-профессия, пришедшая с запада вместе с переселенцами — ремесленниками или торговцами. Географически её стоит искать в бывших черте оседлости: Волынь, Подолье, Белоруссия. В современной России фамилия почти не встречается, что подтверждает её западное происхождение.