Фамилия Габзалилова — редкая, с прозрачной, но неочевидной для русского уха основой. Её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса и географии. Суффикс «-ова» указывает на принадлежность: это женская форма от мужской фамилии Габзалилов. Сама же основа явно восходит к тюркскому или арабо-тюркскому составному имени, что типично для татар, башкир и народов Северного Кавказа.

Первая часть — «Габ-» — это сокращение от арабского «абд» (عبد), то есть «раб», «слуга». В мусульманских именах этот элемент всегда соединяется с одним из эпитетов Аллаха. Вторая часть — «залил» — скорее всего, искажённое или диалектное произношение арабского «Джалиль» (جليل), что значит «великий», «могущественный». Таким образом, мужское имя Габзалил (или Абдул-Джалиль) означает «раб Великого», то есть «раб Аллаха». Это одно из теофорных имён, распространённых в исламской среде.

Фамилия образована по русской модели: к тюркскому имени Габзалил добавили русский патронимический суффикс «-ов», а затем стандартное окончание женского рода. Такая гибридная форма — признак того, что предки жили в регионе с длительным русско-тюркским двуязычием, скорее всего, в Поволжье (Татарстан, Башкортостан) или на Южном Урале. В этих местах в XVIII–XIX веках при переписях крещёным татарам и башкирам часто давали фамилии на «-ов/-ев» от отцовских имён.

Других версий немного. Встречается написание Габзалилов с одной «л», но это просто фонетический вариант. Попытки связать фамилию с каким-либо ремеслом или прозвищем ошибочны: основа — имя, а не нарицательное слово. Сословно предки Габзалиловы, скорее всего, были государственными или ясачными крестьянами, реже — служилыми людьми из «инородцев». Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

По данным открытых источников, фамилия сегодня встречается преимущественно в Челябинской области и Башкортостане, единичные носители — в Москве и Татарстане. Встречаемость низкая, что подтверждает её локальное происхождение от конкретного родового имени.