Фамилия Гамишаев — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного указания на профессию или внешность, зато есть характерный суффикс, который сразу сужает круг поиска. Суффикс -ев указывает на отчество: Гамишаев — это «сын Гамишая». А вот имя или прозвище Гамишай — ключ к разгадке.

Скорее всего, основа фамилии — тюркская. В языках народов Кавказа и Поволжья (кумыкском, азербайджанском, татарском) есть слово «гамыш» или «камыш» — тростник, камыш. Суффикс -ай в тюркских именах и прозвищах часто придаёт ласкательный или уменьшительный оттенок, либо служит для образования личного имени. Таким образом, Гамишай могло быть прозвищем человека, жившего у камышей, занимавшегося их заготовкой, или же именем-оберегом, данным по названию растения. В этом случае фамилия Гамишаев означает «потомок того, кого звали Гамишай».

Менее вероятная, но возможная версия — связь с арабским «хамиш» (пятый). В некоторых тюркских диалектах «гамиш» могло означать «пятый ребёнок» или относиться к какому-то порядковому номеру. Однако эта гипотеза слабее: прозвища по счёту детей встречаются, но редко образуют фамилии с суффиксом -ай.

Географически фамилия тяготеет к Северному Кавказу, особенно к Дагестану и Чечне, а также к Астраханской области и Нижнему Поволжью — регионам, где исторически смешивались тюркские и кавказские языки. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении: возможно, один род или несколько семей, разошедшихся по разным аулам.

По социальному статусу предки Гамишаевых, скорее всего, были крестьянами или скотоводами, жившими вблизи водоёмов. Камыш в тех краях — не сорняк, а ценный материал для строительства, плетения и корма скота, так что прозвище могло быть и профессиональным. Никакой информации о дворянском происхождении или известных исторических носителях фамилии нет — это рядовая, но по-своему яркая фамилия, корни которой уходят в повседневный быт и природу южных степей.