Фамилия Ганадьян звучит не по-русски, и это верный ход для начала: её южнославянское или румынское происхождение почти не вызывает сомнений. В основе лежит личное имя или прозвище Ганадь, которое восходит к греческому имени Геннадий (Gennadios) — «благородный», «родовитый». В болгарском, сербском и молдавском языках греческое «Геннадий» закономерно перешло в форму «Ганадий» или «Ганадь»: упрощение начального «ге-» в «га-» и смягчение конечного согласного — типичные фонетические процессы для балканских говоров. Таким образом, Ганадьян — это отчество, буквально «сын Ганадия» или «потомок Ганадия».

Суффикс -ян (вариант -ан) в этой фамилии — не армянский, как может показаться на первый взгляд, а южнославянский или румынский патронимический формант. В болгарском и сербском языках суффикс -ян/-ан часто образует фамилии по модели «основа имени + -ян»: например, Богдан → Богданян, Радован → Радованян. В румынской ономастике суффикс -eanu (в русской передаче -ян) также распространён и указывает на принадлежность к роду или местности. Поэтому Ганадьян мог возникнуть и у южных славян, и у румын (молдаван) как фамилия, закрепившаяся за родом, ведущим начало от человека по имени Ганадь.

Написание фамилии с мягким знаком («дь») — важная деталь. Оно указывает на то, что в исходном произношении был мягкий звук [д']: Ганадь. Если бы фамилия была армянской, мы бы ожидали форму Ганадьян с твёрдым «д» или вариант Ганатян (через «т»). Мягкий знак в русской записи — попытка передать именно южнославянскую или румынскую мягкость согласного, что делает версию о балканском корне более убедительной.

Сословная принадлежность первых носителей фамилии не прослеживается по данным ономастики: Ганадьян — не дворянская и не купеческая фамилия, а скорее крестьянская или мещанская, типичная для сельских общин Балкан и Бессарабии. В России и на Украине эта фамилия встречается редко, чаще всего у потомков переселенцев из Молдавии, Болгарии или Сербии, которые могли осесть в Новороссии или на Кубани в XIX — начале XX века.