Фамилия Ганецький — редкий пример, где польская и украинская традиции образования фамилий сошлись в одной точке. Её основа — корень «ганец», который почти наверняка восходит к польскому ganiec (гонцу, вестнику) или к украинскому «ганець» (то же значение). Суффикс -цьк-/-цк- типичен для фамилий шляхетского происхождения: так в Речи Посполитой оформляли прозвища, указывая на принадлежность к местности или роду занятий. В данном случае Ганецький — «сын гонца» или «тот, кто связан с гонцами». Носитель такой фамилии мог быть потомком человека, который служил посыльным, курьером, или же жил в местности, называвшейся Ганец (хотя географических названий с таким корнем почти не сохранилось).

Спорный момент — возможная связь с древневерхненемецким Gann (гусь) или с литовским ganyti (пасти). Но эти версии слабы: ни в польской, ни в украинской ономастике нет устойчивых примеров перехода таких корней в фамилию на -цький. Правдоподобнее всего — происхождение от профессии, и здесь фамилия родственна более известным Гончаренко, Гончарову, но с иной географией: Ганецький — типичная фамилия для западноукраинских и польских земель, особенно Волыни и Подляшья.

В написании через «є» (Ганецький) видна украинская адаптация польского Ganiecki. Если бы фамилия осталась в польском варианте, она звучала бы как Ганецкий (с твёрдым «ц»). В XIX веке такие фамилии часто русифицировали, добавляя окончание -ов, но Ганецький сохранил исходную форму — возможно, потому что носители не входили в дворянское сословие, где переоформление было обязательным. Сегодня фамилия встречается редко, в основном в западных областях Украины и среди потомков эмигрантов в Канаде и Аргентине.