Фамилия Ганибоев — редкий случай, когда географический ключ к происхождению почти надёжнее лингвистического. В русском ономастиконе фамилий с окончанием «-боев» немного, и почти все они указывают на регионы Северного Кавказа или Закавказья, где русская фамильная модель (-ов/-ев) наложилась на местные имена или прозвища.

Основа здесь, скорее всего, личное имя Ганиб. Это арабское имя, вариант более известного Ханиф (Hanif) — «истинно верующий», «правоверный», «склонный к единобожию». В тюркских и кавказских языках звук «х» часто выпадает или заменяется на «г», отсюда форма Ганиб. Суффикс «-ой» в середине фамилии (Ганиб-ой) — это типичный для осетинского, ингушского, чеченского языков патронимический показатель, означающий «сын» или «принадлежащий». Таким образом, Ганибоев — это «сын Ганиба», но оформленный уже по русской модели: к осетинской основе «Ганибой» прибавили русский суффикс «-ев».

Вторая, менее вероятная версия, отталкивается от тюркского слова «гяни» (богатство, сокровище) или «гани» (обильный). В этом случае Ганибоев могло бы значить «богатый боец» или «обильный войной», но это выглядит как искусственное прозвище, а не как родовое имя. Арабское имя Ганиб встречается в мусульманских святцах, и его производные фиксируются среди осетин-мусульман и народов Дагестана.

Носители фамилии Ганибоев сегодня живут в основном в Северной Осетии (Алании), а также в Кабардино-Балкарии и Ставропольском крае. Встречается она и в среде ингушей. Сословно предки Ганибоевых могли быть как рядовыми общинниками, так и представителями военного сословия — в Осетии фамильная система долго сохраняла связь с родовыми башнями и военной организацией.

Итог: фамилия Ганибоев — гибридная, осетино-русская по форме и арабо-мусульманская по корню. Её носитель почти наверняка имеет корни с Кавказа, а его предок носил имя Ганиб, что значило «правоверный» или «истинно верующий».