Фамилия Ганиярова — женская форма, мужской вариант — Ганияров. Её основа — личное имя Ганияр, которое имеет сложное тюркское происхождение. Чаще всего его возводят к двум корням: «ган» (кровь, род, происхождение) и «яр» (возлюбленный, друг, спутник). В целом, имя Ганияр можно истолковать как «родной друг» или «близкий по крови». Встречаются и другие версии: например, что первая часть восходит к арабскому «гани» (богатый), а вторая — к персидскому «яр». Тогда имя означало бы «богатый друг». Но первая трактовка встречается в ономастических справочниках чаще.

Фамилия образована типичным для Поволжья и Урала способом: к основе добавили русский патронимический суффикс -ов (в женском роде — -а). Такая модель характерна для татарских, башкирских и других тюркских фамилий, которые фиксировались в документах после введения всеобщей переписи. Мужчина по имени Ганияр становился Ганияровым, его дети — тоже, а жена или дочь — Ганиярова.

Географически фамилия Ганиярова чаще всего встречается в Башкортостане и Татарстане, а также в соседних регионах — Оренбургской, Челябинской, Самарской областях. Это указывает на то, что предки носителей фамилии жили на территории исторического Урало-Поволжья. Среди возможных занятий — земледелие, скотоводство, ремесло; в документах XVIII–XIX веков люди с таким именем нередко числились тептярами или башкирами-вотчинниками.

В написании фамилии возможны варианты — Ганиярова и Ганиярова, с ударением на второй или третий слог. Первый вариант (с ударением на «я») более распространён в татарской среде, второй (на «и») — в русскоязычной документации. Встречается также однокоренная фамилия Ганиев, но она образована от другой формы имени — Гани.