Фамилия Ганудель звучит необычно для русского уха, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, перед нами фамилия, образованная не от славянского корня, а от личного имени или прозвища, попавшего в русскую среду через соседние языки. Основная версия связывает её с именем Ганна — западноукраинской, белорусской или польской формой канонического имени Анна. В этом случае суффикс -дель указывает на характерный способ словообразования: от основы «Гануд-» (как вариант произношения имени Ганна в косвенных падежах) с помощью уменьшительного или фамильного форманта. Подобные модели встречаются в польской и украинской ономастике, где -ель, -уль, -дель часто дают фамилии со значением «сын такого-то» или «маленький, родной».

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным глаголом «гануть» (гадать, предполагать) или «ганьба» (позор, стыд) в белорусском и украинском языках. Однако в этом случае фамилия скорее звучала бы как Гануть или Ганьба. Форма на -дель заставляет склоняться к антропонимическому, а не прозвищному происхождению.

Географически фамилия Ганудель редкая и тяготеет к западным областям бывшей Российской империи — современной Западной Украине, Беларуси и восточным воеводствам Польши. Встречается она и среди еврейского населения этих земель, где могла быть адаптацией имени Ханна (Хана) с добавлением славянского суффикса. Социальный состав носителей, скорее всего, был крестьянским или мещанским: фамилии такого типа не имели аристократической окраски и закреплялись за простыми людьми в XIX веке при массовом присвоении фамилий.

Если разбирать словообразовательную модель, то суффикс -ель в русских фамилиях — редкость. Он характерен для польского (-el) и отчасти украинского языка, где образует фамилии от имён (Ян — Янель, Матей — Матеель). Ганудель стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Гануляк, Ганусевич, Ганушевский. Ударение, скорее всего, падает на последний слог — Гануде́ль, что тоже типично для заимствованных фамилий с таким окончанием.