Фамилия Ганушинец — одна из тех, что сразу выдают украинское или белорусское происхождение. Суффикс -ец в восточнославянских фамилиях обычно указывает на принадлежность к определённой местности: так называли выходца из села или города. В данном случае основа «Ганушин» могла означать «из Ганушина» — гипотетического села или хутора, названного по имени или прозвищу человека. Впрочем, прямой географической привязки к населённому пункту Ганушино в современных источниках нет, хотя топонимы с корнем «Ган-» встречаются на западе Украины и в Польше.

Корень фамилии восходит к личному имени Гануш — это западнославянская и украинская народная форма имени Иоанн (Ян, Иван). В польском и чешском языках Janusz или Hanusz дали множество фамилий: Ганушевский, Ганусяк, Ганушин. Форма Ганушинец — результат адаптации этой основы под восточнославянское словообразование с уменьшительно-притяжательным оттенком. То есть буквально: «сын или потомок Гануша».

Интересная деталь: фамилия редкая, её носители сосредоточены в основном в западных областях Украины (Львовская, Тернопольская, Ивано-Франковская) и среди белорусов. В России она почти не встречается. Это позволяет предположить, что предки Ганушинцев были крестьянами или мещанами из Галиции или Волыни, где польское влияние смешивалось с украинским языком. Суффикс -ец здесь не столько указывает на профессию, сколько на «выходца» — типичную модель для фамилий переселенцев.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Ганушевич, Ганущенко) показывает, что Ганушинец — самая локальная и редкая форма. Если Ганущенко — типичная украинская фамилия на -енко, то Ганушинец стоит особняком: она словно застыла на границе двух языковых миров. Вероятно, в основе лежало прозвище Гануша (ласкательное от Гануш), а уже от него образовали название места или рода. Так что Ганушинец — это не просто «сын Гануша», а скорее «тот, кто из ганушиного рода» или «из Ганушина».