Фамилия Гаптракипова — одна из тех, что напрямую ведут к личному имени предка. В её основе лежит мужское имя Гаптракип, которое представляет собой диалектный или бытовой вариант арабского имени Габдеракип. Такие фонетические изменения — «Габд» на «Гапт» — обычное дело при освоении арабских имён в тюркоязычной или татарской среде, где звуки могли упрощаться для удобства произношения.

Имя Гаптракип составное, и его корни уходят в два арабских слова. Первая часть восходит к имени Габде (или Абд), что означает «раб Аллаха», «поклоняющийся». Вторая — Ракип, со значением «страж», «наблюдатель», «всевидящий». Вместе имя осмысляется как «раб всевидящего Аллаха». Родители, давая такое имя, вкладывали в него пожелание сыну быть благочестивым и преданным мусульманином, живущим под присмотром Всевышнего.

Словообразовательная модель проста: к основе Гаптракип добавили типичный русский суффикс -ов, а затем родовое окончание -а. Фамилия закрепилась за потомками, отвечая на вопрос «чей?» — то есть сын или дочь того, кого звали Гаптракипом.

Фамилия эта редкая, и её география, скорее всего, связана с регионами традиционного проживания татар и башкир, где арабские имена через исламскую культуру вошли в повседневный обиход. Встречаются и однокоренные варианты, например Гаптракипов, Гаптракипова — разница только в роде носителя. В отличие от фамилий на -ин или -ский, здесь мы видим более позднюю и стандартизированную модель оформления, которая не указывает на сословную принадлежность, а только фиксирует родство по имени.