Фамилия Гапуник относится к распространенному типу украинских фамилий и образована от крестильного имени Агафон. Фамилия Гапуник восходит к украинскому варианту мужского имени Агафон — Гапон (Гапуня — уменьшительная форма). Согласно другой, менее правдоподобной гипотезе, фамилия Гапуник образована от прозвища Гапа. Согласно одной из версий, в его основе лежит украинское «гапик», т.е. «петля для застегивания одежды». По другой гипотезе, прозвище ведет свое начало от польского слова gapa – «ротозей, разиня, растяпа». В таком случае Гапой могли называть как портного, так и рассеянного человека. Фамилия Гапуник образовалась при помощи суффикса -ник. Поэтому Гапуник буквально понималось как «сын Агафона». Позднее древний суффикс -ник утратил свое прямое значение и сохранился лишь в качестве фамильного.