Фамилию Гардилковский стоит разбирать, отталкиваясь от её неочевидной основы. На первый взгляд она кажется польской или украинской по модели (суффикс -ский, типичный для шляхты), но корень «Гардилк-» не даёт однозначной привязки к распространённому имени или профессии. Скорее всего, в основе лежит прозвище или адаптированное имя.

Самая вероятная версия — происхождение от личного имени Гардил, которое могло быть вариантом крестильного имени Гордий (от древнегреческого «гордый, страшный»). В польской и западнорусской традиции звук «г» часто переходил в «г» твёрдое, а суффикс -ил- придавал уменьшительно-ласкательный оттенок: Гордил → Гардил. Фамилию образовали через притяжательное прилагательное: «чей?» — Гардилков, то есть потомок Гардила, а затем добавили шляхетский суффикс -ский, что дало Гардилковский. Такая модель типична для фамилий, которые оформлялись в XVI–XVII веках на землях Речи Посполитой, особенно на Волыни, Подолье и в Галиции.

Есть и вторая, менее вероятная версия — от географического названия. В Польше и на западе Украины встречаются топонимы вроде Гардилов, Гардиловка. Если предок владел или происходил из такого места, его могли записать как «из Гардилова», что со временем превратилось в Гардилковский. Однако конкретных сёл с таким именем в современных справочниках не зафиксировано, поэтому версия с личным именем выглядит убедительнее.

Суффикс -ский в этой фамилии — не просто признак знатного происхождения. В среде православной и греко-католической шляхты он часто указывал на принадлежность к мелкопоместному дворянству или духовенству. Носитель фамилии Гардилковский мог быть сыном священника, который получил фамилию по названию прихода или по имени отца-основателя.

В современной России фамилия редкая. Встречается в основном в центральных областях и на юге, куда переселялись выходцы с запада во время столыпинских реформ и после войн. Правописание с двумя «л» (Гардилковский, а не Гардиковский) — важная деталь: оно сохраняет память о суффиксе -ил-, который в разговорной речи часто редуцировался.