Фамилия Гайбалиева — женская форма фамилии Гайбалиев, и её происхождение напрямую связано с мужским именем или прозвищем, лежащим в основе. Корень здесь тюркский, и разобрать его стоит через два компонента: «гайб» и «али».

Первая часть — «гайб» — восходит к арабскому слову «гайб» (غيب), которое в исламской традиции означает «сокровенное», «скрытое», «невидимое». В тюркских языках это слово вошло в состав сложных имён, часто с религиозным оттенком. Вторая часть — «али» — это имя Али (علي), означающее «высокий», «возвышенный», «великий». Сращение даёт имя Гайбали (или Гайбала), которое можно истолковать как «сокровенный Али» или «скрытый величием». Такие двухосновные имена характерны для мусульманской ономастики Поволжья и Кавказа, где арабские корни переплетались с местными тюркскими нормами словообразования.

Фамилия образована по русской модели патронимических фамилий: к основе Гайбали- добавляется суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягкого согласного). В русской канцелярской практике XIX–XX веков тюркские имена часто русифицировали именно так: имя отца становилось фамилией сына, а дочери и жёны получали окончание -а. Поэтому Гайбалиева — это буквально «дочь или жена Гайбалия».

Географически фамилия тяготеет к регионам, где распространены тюркские народы, исповедующие ислам: Татарстан, Башкортостан, Азербайджан, Дагестан. Встречается она и среди кумыков, и среди азербайджанцев. В русских переписях и документах фамилия фиксируется с конца XIX века, но основной приток носителей в центральную Россию пришёлся на советское время, когда миграция из республик усилилась.

В отличие от многих русских фамилий, где суффикс -ев указывает на принадлежность (например, Иванов — сын Ивана), здесь мы видим не славянское имя, а полное тюркское имя-композит. Это делает фамилию Гайбалиева ярким примером межкультурного заимствования: арабская лексика, тюркская основа имени и русский фамильный формант. Никаких других версий, кроме как от имени Гайбали, у этой фамилии нет — попытки связать её с русским словом «гайка» или «балий» (лекарь) лингвистически несостоятельны, так как не объясняют ни ударения, ни суффиксальной модели.