Фамилия Гдков — редкий случай, когда основа слова привела к путанице в произношении и написании. По правилам русской орфографии, сочетание согласных «гд» на стыке приставки и корня встречается (ср. «где», «гдыньский»), но в фамилиях оно почти не фиксируется. Скорее всего, мы имеем дело с искажением исходной формы, вызванным диалектной или бытовой редукцией.

Наиболее вероятная версия — фамилия Гдков восходит к прозвищу Гдок или Гдка. В русских говорах «гдок» могло быть вариантом слова «гдѣ» (где) в значении «бродяга», «тот, кто не сидит на месте». Такое прозвище давали непоседливому человеку, страннику или тому, кто часто менял место жительства. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Гдка» или «из рода Гдка». Модель образования типична для прозвищ, которые не связаны с именем или профессией, а описывают характер.

Менее правдоподобная, но возможная версия — связь с топонимом. В России есть несколько мелких населённых пунктов с корнем «Гд-» (например, Гдов, Гдунь), но фамилия Гдков не выводится напрямую из названия города Гдов: житель Гдова получил бы фамилию Гдовский или Гдовцев. Если предок происходил из деревни с названием Гдки (гипотетически), то фамилия могла образоваться по модели «из Гдок → Гдков», но документальных подтверждений этому нет.

В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) фамилия Гдков не упоминается, что подтверждает её редкость. Встречается она преимущественно в центральных и северных областях России, где диалектное произношение могло «съедать» начальные гласные или смягчать согласные. Возможно, исходной формой была фамилия Годков (от имени Годко — уменьшительное от Годослав или от прозвища «годный»), которая в устной речи превратилась в Гдков из-за беглости гласного.

Таким образом, носитель фамилии Гдков может считать своим предком человека с прозвищем Гдок — вероятно, непоседу или странника. Фамилия закрепилась в той форме, в какой её записал писарь на слух, и это делает её живым свидетельством народной фонетики.