Фамилия Гечер — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение не лежит на поверхности. В основе почти наверняка лежит не славянский, а немецкий или еврейский (идиш) корень, что сразу отличает её от подавляющего большинства русских фамилий на -ов и -ин.

Самый вероятный путь образования — от немецкого прозвища или профессии. Слово «Gecher» или «Gächer» в южнонемецких диалектах могло означать «крикун», «горлопан» или «забияка» (от глагола gechen — кричать, шуметь). В таком случае фамилия родилась как прозвище человека с громким голосом или сварливым характером. Менее распространённая, но тоже возможная версия — от профессии: в некоторых регионах Германии так называли сборщика податей или вышибалы (человека, который «выкрикивал» имена или объявления на рынке).

В еврейской среде фамилия Гечер (געכער) могла возникнуть как вариант фамилии Геккер или от аббревиатуры, но это менее типично. Чаще всего ашкеназские фамилии на -ер указывают на профессию или место жительства, и «крикун» здесь — самое прямое объяснение.

Суффикс -ер в этой фамилии — типичный немецкий формант, обозначающий деятеля. В России такие фамилии закрепились у потомков немецких колонистов, переселившихся в Поволжье, Причерноморье или Прибалтику в XVIII–XIX веках, а также у евреев, получивших фамилии в черте оседлости в начале XIX века. География бытования фамилии сегодня — преимущественно западные регионы России, Украина, Молдова, а также Израиль и Германия. В дореволюционных источниках встречается написание через «ё» — Гёчер, что подтверждает немецкое произношение.

С точки зрения словообразовательной модели, фамилия Гечер — «чистая» основа без русского патронимического суффикса. Она не склоняется по падежам как типичная русская фамилия, что тоже выдает её иноязычное происхождение. Встречаются единичные случаи, когда фамилию русифицировали добавлением -ов (Гечеров), но это исключение, а не правило.