Фамилия Гектина — редкий случай, когда географическое распространение подсказывает разгадку лучше, чем прямой разбор корня. Встречается она почти исключительно на юге России и в Поволжье, особенно в Ростовской области и Краснодарском крае. Эта привязка к казачьим и переселенческим территориям — ключ к версии происхождения.

Скорее всего, основа фамилии — прозвище Гекта. Слово «гекта» в южнорусских говорах имело значение «придирчивый, дотошный человек» или, в ином оттенке, «скупой, скряга». Глагол «гектать» в диалектах означал «кричать, гикать», но также «жадно хватать, зажимать». Прозвище могли дать либо человеку с резким, требовательным голосом, либо тому, кто постоянно торговался и не давал спуску. Фамилии на -ин образуются от основ на -а (-я): Гекта → Гектин, а женская форма — Гектина.

Менее вероятна, но возможна связь с тюркским корнем. В языках народов, соседствовавших с казаками (ногайцы, татары), есть слово «гек» — «синий, голубой». Прозвище Гекта могло означать «синеглазый» или «человек в синей одежде». Однако для фамилии с суффиксом -ин и русским окончанием это скорее заимствование через прозвище, а не прямой этноним.

Фамилия не дворянская и не старинная московская. Она из позднего слоя — фамилий бывших крестьян и казаков, которые оформились в XVIII–XIX веках по месту службы или по прозвищу. В архивах можно найти записи о Гектиных в станицах Области Войска Донского. Ударение, судя по живой речи носителей, чаще падает на второй слог: Гекти́на.