Фамилия Гембера — редкий случай, когда географическая привязка сразу сужает круг поиска. Основная масса носителей этой фамилии в России — потомки грузинских дворян, имеющих немецкие корни. В Грузии фамилия Гембера (გემბერა) встречается в основном среди старых тбилисских семей, и её происхождение напрямую связано с немецкими колонистами, приглашёнными в Закавказье в начале XIX века.

Словообразовательная модель здесь проста: фамилия не получила русского суффикса (-ов, -ин, -ский), а сохранилась в исходной, «голой» форме. Это характерно для фамилий иностранного происхождения, которые не адаптировались через типичные славянские патронимические окончания. В Грузии такую форму часто оставляли без изменений, особенно если род был известен и имел привилегии.

Значение корня восходит к немецкому Gämse — «серна» (горная коза). Вероятно, прозвище Gämse или Gämber дали человеку, который отличался ловкостью, быстротой или жил в горной местности. В южногерманских диалектах, откуда происходили многие колонисты, слово звучало близко к «Гембер». Второй вариант, менее вероятный, но возможный: отчество от личного имени Gembert (древнегерманское gēr — «копьё» + berht — «светлый, знаменитый»).

Социальный контекст фамилии необычен. В отличие от большинства немецких фамилий, которые в России часто «обрусевали» (Шмидт — Шмитов, Фишер — Фишеров), форма Гембера сохранилась именно благодаря грузинской среде. В XIX веке немецкие специалисты — инженеры, виноделы, аптекари — селились в Тифлисе и Кутаиси, и их потомки нередко входили в состав грузинского дворянства. Поэтому у фамилии двойная родословная: немецкая основа и грузинская история бытования.

Если искать однокоренные фамилии, то в немецком пространстве это Gämse, Gember, Gämperle. В России же Гембера стоит особняком — её не спутаешь ни с Гамберовым, ни с Гембелем. Это редкий пример фамилии, которая не «переводилась» на русский, а перешла в новый язык целиком, как есть.