Фамилия Гемборис звучит нетипично для русского уха, и это сразу подсказывает её происхождение. Скорее всего, перед нами фамилия балтийского, а именно литовского или латышского корня. Характерное окончание -ис выдает в ней литовский вариант оформления фамилий, где -is — это типичный падежный суффикс, закрепившийся в русской передаче. В польском языке аналогичная фамилия могла бы писаться как Gęborz или Gemborz, но славянских суффиксов -ов/-ев в ней нет, что указывает на её прямое заимствование.

Основа фамилии — Гембор- — восходит, вероятнее всего, к литовскому слову gembė или gemba, что означает «шишка», «нарост», «выступ». В переносном смысле так могли прозвать человека с заметной особенностью внешности, например, с шишкой на голове или с крупной родинкой. Однако есть и другая версия: в литовском языке gembė также может обозначать «крюк» или «зацепку», что намекает на прозвище цепкого, упрямого человека, который «цепляется» за своё. В любом случае, прозвище было описательным, а не профессиональным.

Географически фамилия Гемборис тяготеет к западу современной Беларуси, Литве и северо-востоку Польши — регионам, где веками жили балто-славянские контактные зоны. В Российской империи такие фамилии часто фиксировали у крестьян и мещан, попавших в ревизские сказки при переходе на русскую письменность. Сословная принадлежность предков, скорее всего, была крестьянской или мелкошляхетской (однодворческой), но точных данных по этой фамилии в открытых источниках мало.

Интересно, что фамилия Гемборис почти не встречается за пределами бывшего Великого княжества Литовского. В современной России она редка, и её носители — это, как правило, потомки переселенцев из западных губерний в ходе столыпинской реформы или в советское время. В написании возможны варианты: Гембори́с (с ударением на последний слог) или Гембо́рис (на второй), что зависит от местной традиции произношения.