Фамилия Генбутис — яркий пример литовской фамилии, которая при советской власти и в постсоветский период нередко оказывалась на картах России и других республик бывшего СССР. Её основа — литовское слово «genys» (дятел) или «ginti» (защищать, гнать). Однако наиболее вероятным источником является прозвище Genys, то есть «Дятел». В литовской антропонимии такие «птичьи» прозвища были распространены: они могли указывать на внешность человека (острый нос, цепкий взгляд), его манеру поведения (настойчивый, «долбящий» одно и то же) или профессию (например, лесоруба — по аналогии с тем, как дятел «долбит» дерево).

Суффикс -ис (-is) — типичный для литовских фамилий, образованных от прозвищ или имён. Он выполняет роль притяжательного показателя, буквально означая «сын такого-то» или «относящийся к такому-то». Таким образом, Генбутис — это «сын Генбутиса» или, если разложить на составные части, «тот, кто происходит от Дятла». Полная форма фамилии с суффиксом -utis (-утис) — уменьшительно-ласкательный вариант, распространённый в Жемайтии (западная Литва). То есть Генбутис — это не просто «Дятлов», а скорее «Дятлик» или «маленький Дятел», что придаёт фамилии оттенок фамильярности или принадлежности к младшей ветви рода.

Встречаемость фамилии крайне низкая. По открытым данным, носители Генбутис сосредоточены в основном в Литве (особенно в Шяуляйском и Паневежском уездах) и среди потомков литовских переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке. В России фамилия — редкая, её можно найти в единичных записях, чаще всего с «русифицированным» окончанием (Генбутис без изменения, реже — Генбутов). Из-за редкости фамилия не попала в массовые ономастические словари, но её разбор легко укладывается в модель, описанную в работах Б. Унбегауна и В. Никонова: литовская основа + типичный суффикс.

Спорным моментом остаётся вторая часть корня. Некоторые исследователи допускают, что «-бут-» может восходить к литовскому «būti» (быть) или «butas» (квартира, поместье), что давало бы значение «защитник жилья» или «домосед». Однако для фамилии Генбутис эта версия слаба: в литовской ономастике обычно не склеивают глагол «быть» с названием птицы. Правдоподобнее считать, что «Генбут-» — это диалектный вариант основы «Gen-» с наращением «-but-», характерным для жемайтийских говоров.