Фамилия Генушев — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В ней нет привычного славянского корня, который сразу подсказал бы занятие или внешность предка. Скорее всего, в основе лежит неканоническое, то есть не церковное, а мирское имя или прозвище Генуш. Такие имена на -уш были характерны для северных и северо-западных русских говоров, где ласкательно-уменьшительные формы образовывались от самых разных основ. Например, от имён Геннадий (Гена) или Евгений (Геня) вполне могло возникнуть прозвище Генуш — так в семье или в деревне называли человека.

Суффикс -ев указывает на типичную русскую патронимическую модель: «чей?» — Генушев, то есть сын или потомок Генуша. Важная деталь: написание через «е» (а не через «ё») в суффиксе под твёрдым согласным «ш» — это норма для фамилий, образованных от основ на мягкий согласный или шипящий. Если бы в основе было слово «генуш» с ударением на последний слог, фамилия могла бы писаться как Генушёв, но закрепился именно вариант Генушев.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом «генуша» или «генуха». В некоторых говорах так могли называть человека нелюдимого, угрюмого или, наоборот, хитрого. Однако эта гипотеза слабая: слово не зафиксировано в авторитетных словарях русских говоров как распространённое. Поэтому версия с происхождением от имени-прозвища Генуш остаётся основной.

Фамилия не принадлежит к числу дворянских или старых купеческих родов, известных по родословным книгам. Скорее всего, её носители — выходцы из крестьянской или мещанской среды, возможно, из районов, где было распространено имя Геннадий в его обиходной форме. Географически фамилия встречается крайне редко, в основном в центральной России и Поволжье, что косвенно подтверждает её позднее формирование — не ранее XVII–XVIII веков, когда фамилии стали массово закрепляться за крестьянами.

Если сравнивать Генушева с однокоренными фамилиями, то можно вспомнить Генухов, Генушкин, Генутов — все они построены по одной модели от разных вариантов того же имени. Но Генушев среди них выделяется своим суффиксом, который в русской ономастике чаще встречается у фамилий, образованных от прозвищ, а не от крестильных имён в полной форме. Это ещё один аргумент в пользу того, что предок нынешних Генушевых был известен в своей среде именно как Генуш — возможно, по какому-то личному качеству или особенности, а не просто по имени, данному при крещении.