Фамилия Гезенцев — одна из тех, где география предков зашифрована прямо в основе. Скорее всего, её носитель в прошлом получил прозвище Гезенец. А оно, в свою очередь, указывает на выходца из определённого места.

Самая прямая версия связывает прозвище с немецким посёлком Гёзен (Gösen) в Тюрингии. Человека, перебравшегося оттуда в русские земли, могли прозвать «гёзенец» — то есть «тот, кто из Гёзена». Со временем звучание могло упроститься до «гезенец», а суффикс -ев добавил фамилию по отцу: «чей?» — Гезенцев.

Есть и более широкая географическая гипотеза: основа та же, но вместо маленького посёлка — целая федеральная земля Гессен (Hessen). В этом случае прозвище «гессенец» (или «гезенец») давали выходцу из этого региона. Учитывая, что Гессен — историческая область, откуда в Россию в разное время приезжали мастера, офицеры и колонисты, версия выглядит правдоподобно.

Менее вероятна тюркская версия — от карачаево-балкарского «гезен» («кладовка»). Если принять её, прозвище Гезенец могло получить либо запасливый хозяин с большим амбаром, либо, напротив, прижимистый человек. Но для фамилии с типичным русским суффиксом -цев и явной «немецкой» огласовкой основы этот вариант скорее исключение.

Сама модель образования — от прозвища на -ец через фамильный суффикс -ев — характерна для русских фамилий, которые фиксировали происхождение человека «откуда-то». Так появились, например, Тамбовцев, Ростовцев, Казанцев. Гезенцев стоит в том же ряду, только указывает не на русский город, а на немецкую землю.