Фамилия Гибзун — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет типичных русских фамильных суффиксов (-ов, -ин, -ский), что сразу указывает: перед нами не великорусская фамилия в классическом понимании, а, скорее всего, позднее заимствование или фамилия, сложившаяся в иноязычной среде.

Наиболее вероятная версия — еврейское происхождение. В ашкеназской ономастике фамилии на -ун встречаются, хоть и не так часто, как на -ман или -зон. Основа «Гибз-» может восходить к ивритскому слову «гибзор» (גִּבּוֹר) — «силач», «герой», «богатырь». В таком случае Гибзун — это вариант фамилии Гиббор или Гиббер, где суффикс -ун играет уменьшительно-ласкательную или патронимическую роль (буквально «сын силача» или «маленький герой»). Фамилии такого типа нередко давали как прозвище по физической силе или отваге, а позже закрепили как родовое имя.

Вторая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование, — тюркская. В языках тюркской группы есть корень «гиб» или «гип», связанный с изгибом, кривизной (сравните: «гибкий»). Однако в тюркских фамилиях суффикс -ун встречается в причастиях или отглагольных формах (например, «козгун» — взбунтовавшийся), и «Гибзун» могло бы означать «согнутый» или «сгорбленный». Но эта версия слабее: фамилия не фиксируется в известных списках тюркских родов, а её звучание ближе к еврейской модели.

Географически фамилия Гибзун встречается в основном у еврейских общин Восточной Европы — в документах XIX века её можно найти в черте оседлости (Украина, Беларусь, Молдавия). В России после революции фамилия могла «русифицироваться» через добавление окончания: Гибзунов, но исходная форма сохранилась в немногочисленных семьях. В советских архивах носители фамилии фиксируются в Одессе, Кишинёве, а также в эмигрантских списках в Израиле и США.

В русском языке фамилия не склоняется по падежам (мужская и женская формы совпадают), что тоже типично для заимствованных фамилий на согласный. Ударение, судя по аналогиям, падает на последний слог: Гибзу́н.

Словообразовательно фамилия проста: корень Гибз- + суффикс -ун. Если верна еврейская версия, то это одна из тех фамилий, где прозвище перешло в родовое имя без изменений, сохранив прямую связь с качеством предка — силой и удалью.