Фамилия Гигоян — характерный пример армянской модели образования фамилий, которая складывалась в основном в XIX веке. В её основе лежит суффикс -ян, восходящий к древнему -янц, что означало «потомок» или «принадлежащий к роду». Таким образом, носитель фамилии Гигоян — это человек из рода Гиго. Сама основа «Гиго» — это, скорее всего, краткая или народная форма от армянского имени Григор (Григорий). В армянском языке распространено явление усечения имён: от полного Григор образовались формы Григо, Гиго, а также Гриша, Гирго. Поэтому фамилия Гигоян буквально означает «потомок Гиго», то есть «потомок Григора».

Географически фамилия Гигоян чаще всего встречается среди армян, чьи предки происходили из Западной Армении (исторические области на востоке современной Турции), а также из региона Нагорного Карабаха и Сюника. После геноцида армян 1915 года и последующих миграций носители фамилии расселились по всему миру, но значительные общины сохранились в Армении, России, Грузии и странах Ближнего Востока. В отличие от русских фамилий, которые часто привязывали человека к сословию или профессии, армянские фамилии на -ян в основном указывали на родство и имя основателя рода. Поэтому сословная принадлежность предков по фамилии не определяется: среди Гигоянов могли быть и ремесленники, и крестьяне, и священники — всё зависело от конкретного рода.

Интересная деталь, которая выделяет эту фамилию среди других армянских: в ней нет диалектных или региональных искажений, характерных для некоторых вариантов (например, Гигоян против Гигоянц). Форма с суффиксом -ян стала общелитературной и закрепилась в паспортной системе Российской империи и СССР. В отличие от фамилий, образованных от ремёсел (например, Дарбинян — «кузнец») или географических названий, Гигоян — чисто патронимическая, и её расшифровка проста: имя предка, ставшее родовым знаком.