Фамилия Гиголян — наглядный пример того, как много даёт для понимания этимологии одна лишь модель образования. Она построена по армянской патронимической схеме с суффиксом -ян, который восходит к древнему -янц и означает «из рода такого-то» или «потомок». В русской традиции такой суффикс — верный признак армянского происхождения фамилии, причём в подавляющем большинстве случаев она образована от личного имени или прозвища основателя рода.

Основа фамилии — Гигол. Это имя или прозвище, которое, скорее всего, восходит к армянскому слову «гиг» (գիգ). В современном армянском языке оно имеет значение «крик, шум, гам» или «ссора, перебранка». Соответственно, Гиголом могли прозвать человека крикливого, шумного или, наоборот, того, кто постоянно оказывался в центре ссор и споров. Впрочем, не исключено, что это вариант более древнего личного имени, которое со временем приобрело прозвищный оттенок, или же фамилия связана с местом происхождения — например, с названием села или местности, где жил род.

Встречается фамилия в основном на юге России, в Краснодарском крае и Ставрополье, а также в Армении и среди армянской диаспоры. География бытования подтверждает, что перед нами типичная фамилия армян-переселенцев, которые в XIX–XX веках оседали в Причерноморье и Предкавказье. С точки зрения словообразования, фамилия Гиголян стоит в одном ряду с такими, как Авагян, Мкртчян или Варданян, — все они образованы по одному принципу: личное имя или прозвище плюс суффикс принадлежности. Разница лишь в том, что основа Гигол — редкая, не такая распространённая, как, скажем, Петрос или Геворг, что делает фамилию более узколокальной и менее тиражированной.