Фамилия Гильмишарипова — редкий случай, когда в одной основе соединились два арабских корня, пришедших через татарский язык. Она образована от мужского имени Гильмишарип, которое складывается из «гильми» (знание, учёность) и «шарип» (благородный, почётный). В буквальном прочтении — «благородное знание» или «почтенный учёный». Такие составные имена были распространены у татар и башкир в XIX — начале XX века: родители вкладывали в имя пожелание ребёнку стать образованным и уважаемым человеком.

Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ов, адаптированным к основе на твёрдый согласный: Гильмишарип + ов + а. Женская форма Гильмишарипова указывает на принадлежность к роду, где мужчину звали Гильмишарипом. Суффикс -ов здесь типичен для фамилий, возникших в среде татарского и башкирского купечества, духовенства или зажиточных крестьян после переписи, когда нужно было зафиксировать родовое прозвище по отцу.

Вероятнее всего, предок носителя фамилии был муллой, учителем в медресе или просто человеком, которого в деревне уважали за грамотность и начитанность. Имя Гильмишарип не давали случайно — его могли получить мальчики из семей, где ценили религиозное образование. Фамилия почти не встречается за пределами Татарстана и Башкортостана, а её носители — потомки тех, кто сохранил связь с исламской книжной традицией.

Любопытно, что вторая часть — «шарип» — в татарском языке имеет и более бытовое значение: «дорогой, ценный». Поэтому фамилию можно трактовать и как «драгоценное знание». Ударение в фамилии чаще всего падает на второй слог: Гильмиша́рипова, хотя в разговорной речи встречается и вариант с ударением на третий.