Фамилия Гисьня — редкий случай, когда географическое прозвище легло в основу родового имени. Скорее всего, её корень восходит к украинскому слову «гес» — так называли жителя Восточной Галиции, то есть территории современных Львовской, Ивано-Франковской и большей части Тернопольской областей Украины. «Гесами» или «гесями» в прошлом могли прозвать выходца из этого края, а затем прозвище закрепилось за его потомками.

Словообразовательная модель здесь нестандартная. Обычно фамилии на -ня (как Гисьня) встречаются реже, чем на -ов или -ин, и часто указывают на украинское или белорусское происхождение. Суффикс -ня мог придавать прозвищу оттенок принадлежности или уменьшительности, но в данном случае он просто оформил основу «гись» (искажённое «гес»). Переход «е» в «и» — характерная черта живого произношения: так закрепилось написание Гисьня, хотя встречаются и родственные варианты: Гисня, Гесня.

География фамилии сегодня неширокая, что подтверждает её локальные корни. Носители Гисьни чаще всего встречаются на западе Украины и в прилегающих областях России, куда переселялись галичане в XIX–XX веках. В дореволюционных документах эта фамилия почти не фиксировалась — вероятно, из-за того, что бытовала в крестьянской среде и не попала в официальные списки дворянских или купеческих родов.

Если кратко: предки человека с фамилией Гисьня почти наверняка были выходцами из Галиции, а сама фамилия — не ремесленная или вотчинная, а чисто «географическая» метка, которая приросла к роду. Других версий, например, от личного имени или профессии, нет — корень «гись» вне галицкого контекста не объясняется.