Фамилия Глацунова — редкий случай, когда географический корень просматривается яснее, чем антропонимический. Наиболее вероятное объяснение: прозвище Глацун образовано от названия города Глацко. Это польское Клодзко (Kłodzko), по-чешски Кладско, а по-немецки Glatz — старинный город в Нижней Силезии, центр Клодзского повята. Предок носительницы фамилии мог быть уроженцем этого города или долго там жить. В пользу этой версии говорит и то, что фамилии, произведённые от топонимов с помощью суффикса -ун, встречаются в западных и юго-западных регионах бывшей Речи Посполитой, откуда люди переселялись в центральную Россию.

Есть и вторая, менее вероятная, но лингвистически возможная гипотеза: Глацунова — вариант фамилии Глазунова. В этом случае основа — прозвище Глазун, которое давали человеку с большими или красивыми глазами. Чередование з/ц (Глазун → Глацун) — результат исторических фонетических процессов, характерных для некоторых говоров, особенно при заимствовании слова через польское или украинское посредничество. Однако в таком случае фамилия теряет географическую привязку и становится чисто описательной, что встречается реже, чем связь с конкретным топонимом.

Итог: фамилия Глацунова образована по стандартной русской модели — от прозвища на -ун с помощью притяжательного суффикса -ов (женская форма -ова). Основная версия — указание на выходца из силезского города Глацко. Альтернативная — фонетический вариант фамилии Глазунов. Обе версии рабочие, но топонимическая выглядит убедительнее из-за точного совпадения корня с названием города.