Фамилия Гнибида звучит необычно и сразу привлекает внимание. Её основа — глагол «гнить» в повелительном наклонении, то есть «гни». Вторая часть — «бида» — это искажённое или диалектное произношение слова «беда». Получается прозвище «Гни беду» — то есть «порти, разрушай неприятности» или, в более мрачном смысле, «гнои беду». Это типичная для украинской и южнорусской ономастики модель прозвища-приказа, вроде «Убейвовк», «Непийпиво» или «Покуйбида». Человек с таким прозвищем мог быть задирой, спорщиком или, наоборот, тем, кто «изводит» чужие проблемы — толкование зависит от контекста, в котором прозвище дали.

По суффиксу -а фамилия относится к типу «украинских» без дополнительного оформления: прозвище напрямую стало фамилией. В XIX веке при переписях населения такие формы часто фиксировались в сёлах Подолья, Волыни, Галиции. Сейчас фамилия редкая, встречается в основном на западе Украины и в смежных регионах Беларуси, а также у потомков переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке.

Слово «бида» вместо «беда» — характерная черта украинских говоров, где «е» переходит в «и» в закрытых слогах. Это подтверждает, что фамилия сформировалась не в великорусской среде, а в украинской или южнорусской диалектной зоне. Споров о происхождении почти нет: все исследователи сходятся на глагольно-именной конструкции, хотя некоторые любители пытаются увидеть здесь тюркские корни — но это натяжка, так как слово «бида» в тюркских языках означает совсем другое («соловей»), и смысл теряется.

Сословно носители Гнибида — почти поголовно крестьяне или казаки. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В реестрах Войска Запорожского XVII–XVIII веков встречаются прозвища похожего строя, но сама фамилия Гнибида, скорее всего, оформилась позже, в период массовой фиксации фамилий в XIX веке.