Фамилия Гниненкео — редкий случай в русской ономастике. С первого взгляда она кажется искусственно созданной или искажённой при переписи, но на деле её можно разобрать по живому словообразовательному следу. Основа здесь — корень «гнил-» или «гнин-», связанный с глаголом «гнить» и прилагательным «гнилой». В диалектах слово «гниль» могло означать не только испорченное дерево или сырость, но и болотистую, топкую землю, непригодную для пашни. Человек по прозвищу Гнила, Гнилой или Гниненко получал его либо по характеру (медлительный, вялый, «гнилой» в переносном смысле), либо по месту жительства — на гнилом, болотистом участке.

Особенность фамилии — суффикс «-ео». В русских фамилиях он почти не встречается; чаще мы видим «-ов», «-ин», «-ский» или украинское «-енко». Форма «Гниненкео» явно вторична: скорее всего, исходное прозвище звучало как Гниненко или Гниленко. Украинский суффикс «-енко» означает «маленький, сын такого-то»: Гниненко — сын Гнилы. При записи в паспорт или в метрическую книгу писарь мог ошибиться, переставить буквы или «украинизировать» окончание на свой лад, написав «Гниненкео» вместо «Гниненко». Встречаются и такие варианты, как Гниненков, Гниленков, где уже русский суффикс «-ов» добавили к той же основе.

География фамилии узкая. Основные носители встречаются на юге России, в Ростовской области и Краснодарском крае, а также в украинских областях — Харьковской, Полтавской, Сумской. Это указывает на происхождение из среды украинского или южнорусского крестьянства. Прозвище «Гнила» или «Гнилой» не было обидным в прямом смысле — его давали людям, жившим на сырых низинах, у болот, или тем, кто отличался спокойным, небыстрым нравом. В казачьей среде такое прозвище могло закрепиться за человеком, который занимался заготовкой сырого леса или жил в месте, где часто гнил урожай.

Итог прост: фамилия Гниненкео — это диалектное или записное искажение украинской фамилии Гниненко, образованной от прозвища Гнила (гнилой, сырой). Предки, скорее всего, были крестьянами или казаками, жившими на влажных землях или отличавшимися неторопливым нравом.