Фамилия Голгожинская — одна из тех, что прямо указывают на географическое происхождение предка. Её основа — топоним Голгожа или Голгожино: так могло называться село, деревня или урочище, откуда был родом первый носитель. Суффикс -ск- в таких фамилиях типичен для польской, украинской и западнорусской традиции, особенно среди шляхты и духовенства. На современных картах названий Голгожа или Голгожино нет, поэтому определить точную локацию трудно — скорее всего, поселение исчезло или сменило имя.

Есть и другая версия, более редкая и сложная. Согласно ей, фамилия восходит не к названию места, а к личному имени Голгожа (в тюркском варианте — Калгожа). Это составное имя: первая часть «кал» («хал») означает «родинка» или «красота, миловидность, обаяние», а вторая — «гожа» — заимствована из персидского и переводится как «хозяин, владелец, господин», а также «наставник, учитель, обладающий большими знаниями». Таким образом, Калгожа буквально — «хозяин с родинкой». В тюркской традиции имя с компонентом «кал» давали ребёнку, родившемуся с родинкой; если родинку замечали позже, имя могли сменить на такое же.

Эти две версии не обязательно исключают друг друга. Вполне вероятно, что сначала существовало личное имя или прозвище Голгожа, а уже от него получил название населённый пункт, жители которого стали Голгожинскими. Какая из гипотез правдоподобнее — сказать сложно, так как фамилия редкая и письменных источников по ней мало. Но в любом случае, фамилия Голгожинская — ценный свидетель семейной истории: она передавалась из поколения в поколение и по сей день хранит память о происхождении человека, будь то затерянное село или древнее тюркское имя.