Фамилия Голгожинский — редкий случай в русском ономастиконе, где польский суффикс накладывается на неочевидную основу. Если отбросить окончание -ий, остаётся корень Голгожин- и суффикс -ск-, типичный для шляхетских или географических фамилий. Такая модель встречается у выходцев из Речи Посполитой: в XVI–XVII веках многие польские и литовские дворяне переходили на русскую службу, а их фамилии адаптировались к местному произношению.

Основа «Голгожин» почти наверняка восходит к названию населённого пункта. В Польше есть несколько мест с корнем Golgo- — например, деревня Голгота (Gołgota) в Малопольском воеводстве. Но более вероятен вариант от Gołogóra — «голая гора» (goła góra), что в польской топонимике встречается часто. При переходе в русский язык «голая гора» могла дать Голгожин через промежуточную форму Гологора — Гологожин — Голгожин. Сжатие гласных — обычное дело при заимствовании.

Вторая версия, менее надёжная: связь с личным именем или прозвищем Голгод (от польского gołgać — «болтать, пустословить»). Но суффикс -ин- в таком случае указывал бы на принадлежность («чей?»), а не на место, что для фамилий на -ский нетипично. Поэтому топонимическое происхождение убедительнее.

В России фамилия Голгожинский встречается крайне редко. По данным переписей и телефонных справочников, основные носители живут в Центральном федеральном округе, единичные — на юге и в Сибири. Это указывает не на массовое переселение, а на локальную ветвь одного рода, возможно, обедневших шляхтичей, которые после разделов Польши оказались в составе Российской империи и осели в поместьях.

Орфографических вариантов почти нет: в документах XIX века изредка фиксируется Голгожинской (с двойным окончанием, по старой традиции), но современное написание устоялось. Ударение, судя по аналогиям (ЖижИнский, ГолЫнский), падает на второй слог: ГолгОжинский.

Что касается сословия: фамилии на -ский в русской среде чаще носили дворяне и духовенство, но для выходцев из Польши это не показатель — там такую форму имели и крестьяне, и мещане, если жили в деревне с соответствующим названием. Так что предки Голгожинских могли быть как мелкими землевладельцами, так и крепостными, перевезёнными помещиком из польских земель.