Фамилия Гомопедрозов — редчайший случай в русской ономастике, и её происхождение вызывает споры. Сразу оговоримся: ничего общего с современными значениями корня «гомо-» или «педо-» у неё нет. Основа фамилии — искусственное, книжное образование, созданное в среде духовенства. В XVIII–XIX веках семинаристам при поступлении нередко меняли фамилии на «благозвучные» греческие или латинские, либо давали новые, переводя бытовые прозвища на церковнославянский или греческий манер.

Скорее всего, Гомопедрозов — это переосмысление греческого слова «гомопедроз» (ὁμοπέδροσος), что буквально означает «единочувственный» или «сочувствующий». В греческом «гомо-» значит «одинаковый», «педроз» — «чувство, страдание». Таким образом, фамилия могла означать «сострадательный» или «сопереживающий» — качество, которое ценилось в священнослужителе. Суффикс «-ов» указывает на принадлежность: «сын того, кого прозвали Гомопедрозом».

Версия о том, что фамилия произошла от прозвища, связанного с каким-либо ремеслом или местностью, маловероятна из-за её книжного, искусственного звучания. Встречаемость фамилии крайне низкая, и география её ограничена, скорее всего, центральными губерниями России, где были сильны семинарские традиции. Искать «известных носителей» в истории не приходится — фамилия осталась в тени, как и многие её «семинарские» собратья.