Фамилия Гомосеченко — редкий пример того, как основа, на первый взгляд кажущаяся иноязычной, на деле оказывается чисто славянской, просто записанной через «о» там, где привычнее было бы «а». Если отбросить суффикс -енко (украинский патронимический формант, означающий «сын» или «потомок»), то в корне остается Гомосеч-. Это не что иное, как фонетический вариант прозвища Гамасека или Гомосека, образованного от глагола «гомозиться» или «гомошить» — в южнорусских и украинских говорах это значит «суетиться», «копошиться», «возиться без толку». Человек, который постоянно суетился, не мог усидеть на месте или делал всё с излишней вознёй, легко получал прозвище Гомосека. Суффикс -ец в основе (Гомосеч- < Гомосек- + -ец) указывал на носителя признака: «суетливый человек». Таким образом, Гомосеченко — это «сын того, кого прозвали Гомосекой», то есть потомок суетливого, непоседливого предка.

Вторая, менее вероятная версия, отталкивается от диалектного «гомон» — шум, гам. В этом случае прозвище Гомосека могло означать «крикун» или «зачинщик шума». Однако глагольная основа («сечь» с приставкой «гомо-» в значении «бить, рубить») здесь не читается: никакой связи с сечением или рубкой у этой фамилии нет, это ложное этимологическое сближение.

Географически фамилия тяготеет к левобережной Украине и югу России, где суффикс -енко особенно распространен. В современных базах данных Гомосеченко встречается единично, что говорит о локальном происхождении: прозвище, скорее всего, закрепилось за одним родом в конкретном селе, а не распространилось повсеместно. По сословной принадлежности предки, вероятно, были крестьянами или казаками — именно в этих средах бытовые прозвища по характеру давали особенно часто.

Примечателен и орфографический аспект: написание через «о» в первом слоге (Гомосеченко, а не Гамасеченко) могло закрепиться под влиянием «акающих» говоров, где безударная «а» звучала как «о», и писарь записал фамилию на слух, как слышал. Это не ошибка, а живая фиксация произношения XIX века.