Фамилия Готайло звучит непривычно для русского уха, и это не случайно: её корни — в балтийских языках, скорее всего, в литовском или белорусском пограничье. В основе лежит личное прозвище или имя Готайла, которое образовано от балтского корня *got- со значением «доставать, добывать» или «хватать». В литовском языке есть слово gotas — «гот» (представитель древнегерманского племени), но для фамилии более вероятна связь с глаголом goti — «хватать, ловить». Человек по прозвищу Готайло мог быть ловким, хватким или заниматься ловлей рыбы, дичи.

Модель образования типична для восточнославянских фамилий на -айло/-ейло, которые часто происходят от прозвищ с суффиксом деятеля. Этот суффикс (сравните с «пугайло», «кричайло») указывал на характерное действие или свойство человека. Со временем прозвище закрепилось как фамилия, особенно на землях Великого княжества Литовского, где балтские и славянские языки активно смешивались. В белорусской ономастике фамилии на -айло встречаются чаще, чем в великорусских говорах, что подтверждает географическую привязку.

В русских документах фамилия Готайло встречается редко, и это не случайно: она не входила в дворянские родословные книги центральных губерний. Скорее всего, предки были крестьянами или мещанами из западных регионов — современной Беларуси, Литвы или Смоленщины. Интересная деталь: написание могло колебаться — в старых записях встречаются варианты Готайла, Готайлов, но форма на -о закрепилась как типичная для белорусских фамилий. Если искать однокоренные, то в той же среде бытовали фамилии Готович, Готовский, но Готайло стоит особняком из-за редкого суффикса, который не даёт спутать её с русскими фамилиями на -ов.