Фамилия Готниковы образована от прозвища Готник. Слово «готник» скорее всего восходит к украинскому «готка» — самка глухаря. Птица глухарь получила своё название за то, что в брачный период самец на время теряет слух и бдительность, чем и пользуются охотники. Поэтому прозвище Готник могло указывать на род занятий: так называли охотника на глухарей. Не исключено и другое объяснение: прозвище могли дать человеку, который напоминал эту птицу — например, был глуховат или, наоборот, шумно вёл себя во время токования.

В русских фамилиях суффикс -ов присоединялся к основам на твёрдый согласный и указывал на принадлежность: Готников буквально значит «сын Готника». Модель типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ов преобладают. Украинское происхождение основы (готка) не должно смущать: прозвища и диалектные слова свободно переходили из одной славянской языковой среды в другую, особенно в пограничных районах или при переселениях.

О точном месте возникновения фамилии Готников говорить сложно — процесс становления фамилий длился столетия, и документальные подтверждения редки. Однако ясно, что эта фамилия сохранила в себе отголосок охотничьего быта и народных названий птиц, что делает её любопытным памятником славянской лексики и культуры.