Фамилия Говгера — редкая, и её происхождение напрямую связано с географией. С высокой вероятностью, это не русская фамилия в классическом понимании, а вариант фамилии еврейской ашкеназской традиции, записанный латиницей или кириллицей.

Основа фамилии — немецкий топоним или название местности. Скорее всего, в основе лежит слово «Gau» (нем. «округ», «область») и «Berg» (нем. «гора») или «Burg» (нем. «крепость»). Сочетание могло обозначать человека из местности «Гауберг» (Gauberg) — такое название встречается в Германии, например, в земле Баден-Вюртемберг. Фамилии, образованные от названий городов или регионов, были типичны для евреев, которым в конце XVIII — XIX веке в Австро-Венгрии и Пруссии предписывалось брать фамилии по месту жительства или произвольно выбранные немецкие слова.

Суффикс «-а» в окончании (Говгера) — характерная черта для фамилий, которые в русском языке склоняются по образцу существительных женского рода. Это могло возникнуть при адаптации исходной формы (например, Gauberg или Gauber) в среде, где говорят по-русски или по-украински. В польском или белорусском контексте фамилия могла бы звучать как Говгер, без окончания, но с ударением на второй слог.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная — связь с немецким словом «Gauner» (мошенник, плут). Однако в этом случае фамилия звучала бы как Гойнер, а не Говгера. Фонетически «Говгера» ближе именно к модели «Gau + Berg», где звук «б» в потоке речи мог редуцироваться или перейти в «в» (Gauberg → Gowberg → Gowgera).

Таким образом, предки носителя фамилии Говгера, скорее всего, жили в немецкоязычной среде (Австрия, Пруссия, Чехия) и получили фамилию по названию местности. В Российскую империю или СССР она попала с волнами миграции еврейского населения в конце XIX — начале XX века. Встречается она крайне редко, в основном у потомков выходцев из черты оседлости.