Фамилия Гукемухов — черкесская, её основа — прозвище или личное имя Гукемух. Разбираем слово по составу: первая часть «гъук1э» в адыгском языке означает «кузнец», буквально — «железо делающий». Вторая часть «махуэ» переводится как «счастливый» или «светлый». Скорее всего, прозвище Гукемух дали человеку, который был не просто кузнецом, а «счастливым кузнецом», то есть удачливым или умелым мастером. Не исключено, что Гукемух могло быть и полным именем, а не прозвищем — в адыгской традиции такие составные имена встречаются.

Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ов, то есть буквально «принадлежащий Гукемуху» или «из рода Гукемуха». Это типичный способ, которым черкесские фамилии адаптировались в русской документации.

Подтверждение тому — архивные записи. В документах начала XX века из Архива Карачаево-Черкесской Республики упоминается Гукемухов Махмуд Тликечевич, который проживал в Черкесском районе, ауле Калмыковском. Эта запись показывает, что фамилия уже тогда бытовала в конкретном регионе и имела отчество, построенное по русскому образцу.

Фамилия редкая, сосредоточена в Карачаево-Черкесии. Других версий происхождения, кроме адыгской, всерьёз рассматривать не стоит — основа прозрачна и хорошо ложится на язык.