Фамилия Гупенюк — украинская по происхождению, с прозрачной, хоть и не единственной, этимологией. Её основа — глагол «гупати», что в украинском языке означает «стукнуть, ударить, бить». Отсюда и главная версия: прозвище Гупенюк могли дать человеку невоздержанному, задиристому, всегда готовому постоять за себя кулаками. Однако та же самая основа допускает и другое, более мирное толкование: предок носителя фамилии мог быть плотником или заниматься другим «шумным» ремеслом, где стук и удары — часть рабочего процесса.

Суффикс -юк типичен для западноукраинской ономастики (Подолье, Волынь, Галичина). Он указывает на принадлежность или родство: Гупенюк — буквально «сын (или потомок) Гупеня». То есть сначала существовало прозвище Гупень (с тем же корнем), а от него уже образовалась фамилия. Интересно, что в украинских говорах встречается и слово «гупа» — так могли назвать неуклюжего или тяжёлого на подъём человека, что добавляет ещё один смысловой оттенок.

Фамилия редкая, в списках частотных украинских фамилий не значится. Встречается преимущественно на западе Украины, единичные носители есть в России и Беларуси — скорее всего, как результат поздних миграций. В дореволюционных метриках фамилия могла писаться через «і» — Гупінюк, что отражает местное произношение.

Таким образом, Гупенюк — типичная украинская фамилия-прозвище, образованная от глагола, описывающего либо характер (драчливость), либо профессию (плотник). Оба варианта правдоподобны, и без точных документальных сведений о конкретном роде предпочесть один другому невозможно.