Фамилия Гурганчиев — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает любые другие версии происхождения. Её основа — топоним Гурганч, историческое название одного из крупнейших городов Хорезма. Сейчас этот город известен как Куня-Ургенч (старый Ургенч) на севере Туркменистана, а в средневековых арабских и персидских источниках он фигурировал именно как Гурганч (или Джурджания). Столица Хорезма, процветавшая до нашествия монголов, дала прозвище выходцам оттуда — «гурганчи», то есть «ургенчец», «житель или уроженец Гурганча».

Суффикс -ев в фамилии работает как стандартный русский патронимический (или вотчинный) формант, но присоединён он не к личному имени, а к прозвищу по месту жительства. Модель простая: прозвище Гурганчи («человек из Гурганча») → Гурганчиев («сын Гурганчи»). Фонетически интересен переход «ч» в «ч» перед суффиксом: в тюркских языках слово «гурганчлы» (ургенчец) дало бы основу «гурганчли», но русская адаптация отсекла тюркский аффикс принадлежности и превратила прозвище в «Гурганчи», а затем в фамилию на -ев.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с тюркским словом «гурган» (курган, крепость, холм) и суффиксом принадлежности. Но в этом случае форма ожидалась бы скорее «Гурганов» или «Гурганчиев» могло бы означать «сын того, кто с кургана». Однако конкретное указание на город Гурганч выглядит убедительнее: фамилия явно хорезмийского круга и встречается у потомков выходцев из Средней Азии, часто у туркмен, узбеков и каракалпаков, принявших русскую фамильную модель.

Сословной привязки у фамилии нет. Гурганчиевы могли быть и купцами, и ремесленниками, и духовными лицами — любой человек, переселившийся из Хорезма в русскоязычную среду, получал такое прозвище. В дореволюционных документах фамилия почти не фиксируется, что говорит о её относительно позднем оформлении (конец XIX — начало XX века), когда русская администрация массово «оканчивала» тюркские прозвища на -ев и -ов.