Фамилия Идлис стоит особняком в ряду русских фамилий: её основа не славянская, а арабская или еврейская, и в русском языке она не имеет очевидного прозвищного или профессионального корня. Это одна из редких фамилий, которые попали в Россию не через крестьянское прозвище, а через книжную, учёную или торговую среду.

Скорее всего, фамилия восходит к арабскому слову «идлис» — так называют пророка Еноха в исламской традиции (Идрис). Имя Идрис встречается у мусульманских народов, и фамилия могла образоваться от него по русской модели: Идрис → Идлис. Второй вариант — от еврейского топонима Идлис (литовское местечко, ныне в Беларуси). Еврейские фамилии часто давали по названию города или местечка, где жила семья. В этом случае Идлис — не имя, а указание на географическое происхождение.

В русском контексте фамилия остаётся крайне редкой. Её носители в Российской империи — как правило, еврейские семьи из западных губерний, а также татарские или кавказские мусульмане, принявшие фамилию по имени предка. Суффикс -с (а не -ов, -ев или -ин) указывает на то, что фамилия могла быть записана в документах без русификации — так часто случалось с иноязычными основами, которые не переделывали под славянскую модель.

Единственный известный носитель, оставивший след в науке, — советский физик Григорий Моисеевич Идлис (1928–2010), специалист по космологии и астрофизике. Его фамилия, скорее всего, имеет еврейское топонимическое происхождение. Это подтверждает и отчество Моисеевич, и место рождения (Харьков, где жило много еврейских семей из западных регионов).

Таким образом, фамилия Идлис не поддаётся однозначной этимологии: это либо «сын Идриса» (арабская именная основа), либо «родом из Идлиса» (еврейский топоним). В любом случае, она пришла в русский язык не из крестьянской среды, а из среды грамотных горожан — купцов, учёных, раввинов.