Фамилия Ифлянцев — редкий случай, когда географическое название стало основой для прозвища, а затем и для фамилии, но с неожиданным суффиксом. В её основе лежит этноним или топоним «Ифлянт» — искажённое «Лифлянт», то есть житель Лифляндии. Лифляндией в XVI–XIX веках называли историческую область на территории современных Латвии и Эстонии (часть Прибалтики, входившая в состав Российской империи). Русские могли называть выходцев оттуда «лифлянтами» или «ифлянтами» — с характерной для народной речи утратой начального «л» (сравните: «Ифлянт» вместо «Лифлянт»).

Словообразовательная модель здесь необычна. Большинство фамилий от названий мест или народов образуются суффиксами -ов/-ев или -ин: скажем, «Литвинов» от «литвин» или «Немцов» от «немец». Ифлянцев же использует суффикс -ев, но с дополнительным элементом -ц-: основа «Ифлянт» → притяжательное прилагательное «Ифлянцев». Суффикс -ц- в таких фамилиях обычно указывает на принадлежность к группе людей или на происхождение от прозвища, оканчивающегося на -ец. То есть сначала могло возникнуть прозвище «Ифлянец» (человек из Лифляндии), а уже от него — фамилия Ифлянцев. Это более редкий путь, чем прямой переход от прозвища «Ифлянт» к фамилии Ифлянтов, но именно вариант с -ц- закрепился.

Вероятнее всего, первый носитель фамилии был не коренным жителем Лифляндии, а русским, который побывал там или имел с ней дело — например, торговец, служилый человек или ремесленник, вернувшийся из Прибалтики. Прозвище «Ифлянец» давали приезжим, чтобы отличить их от местных. Сословно фамилия могла принадлежать крестьянам, мещанам или казакам — в дворянской среде такие «географические» прозвища встречаются реже, хотя и не исключены.

Фамилия крайне редкая. В дореволюционных справочниках она почти не фиксируется, что говорит о её позднем оформлении или локальном бытовании. Встречается она преимущественно на юге России и в Поволжье — в тех регионах, куда в XVIII–XIX веках переселяли выходцев из Прибалтики или где селились отставные солдаты. Сравните с однокоренными фамилиями Лифляндов, Лифляндский, Ифляндов — все они одного корня, но Ифлянцев стоит особняком из-за суффиксальной цепочки.