Фамилия Игитханова — редкий пример фамилии, в основе которой лежит не просто имя или прозвище, а целая составная конструкция из двух значащих частей: «игит» и «хан». Образована она по распространённой модели с суффиксом -ов (-а), типичной для русских фамилий, но происхождение у неё тюркское, точнее — кумыкское или ногайское. Первая часть, «игит» (варианты: йигит, джигит), в тюркских языках означает «молодец», «храбрец», «удалой всадник». Это не этническое прозвище, а социальная или качественная характеристика: так могли назвать ловкого, смелого человека. Вторая часть, «хан», — титул верховного правителя, который в составе личных имён часто служил пожеланием величия или указывал на знатное происхождение (например, Игитхан — «храбрый хан» или «хан-джигит»).

Таким образом, фамилия Игитханова восходит к мужскому личному имени Игитхан. Такие двухосновные имена были характерны для народов Северного Кавказа (кумыков, ногайцев) и некоторых групп тюрков. Имя давали мальчику с надеждой, что он вырастет таким же смелым и достойным, как хан. Сама фамилия — русифицированная форма, которая закрепилась в XIX–XX веках, когда при переписях и паспортном учёте тюркские и кавказские имена оформляли по русскому образцу: к основе добавляли суффикс -ов/-ев или -ин. Форма Игитханова — женская, мужской вариант — Игитханов.

Географически фамилия чаще всего встречается в Дагестане, особенно среди кумыков, а также в Чечне и среди ногайцев Ставрополья. В русском языке она сохранила ударение на последнем слоге основы: Игитха́нов. Фамилия не имеет отношения к армянскому или иранскому корням, хотя «хан» — слово широко распространённое. Это редкий случай, когда в одной фамилии соединились два ярких тюркских понятия — «джигит» и «хан», что делает её этимологию прозрачной и не допускающей споров. Других версий происхождения, сколько-нибудь убедительных, не существует.