Фамилия Игноев — редкий случай, когда на виду не корень, а суффикс. В русских фамилиях формант -ев обычно присоединяется к основам на мягкий согласный или на -й (как в «Андреев» от Андрей). Но здесь основа «Игной» — и это зацепка для разговора.

Скорее всего, перед нами патроним, образованный от неканонического имени или прозвища Игной. В русских говорах слово «игной» фиксировалось в значении «гнилой, испорченный» — так могли прозвать человека неопрятного, хилого или просто сварливого. В. И. Даль в своём словаре приводит форму «игнуть» — «гнить, преть», так что прозвище могло быть не обидным, а скорее бытовым, от внешних примет.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным «игна» (игровая, шаловливая девушка) или с тюркскими корнями, где «иг» означает «нить» или «веретено». Однако для русской фамилии на -ев такая основа нетипична: тюркские прозвища чаще давали фамилии на -ов (Игнов, Игнаев). Поэтому версия с «гнилой» остаётся основной, хоть и не самой лестной.

Фамилия крайне редкая. В дореволюционных метрических книгах она почти не встречается, а в современных справочниках носителей можно пересчитать по пальцам. Географически — скорее южнорусские или центральные губернии, где бытовало слово «игной». Социальный срез: крестьянская среда, где прозвища давали по характерным чертам или состоянию.

Сравните с однокоренными: Игнатов, Игнатьев — от имени Игнатий; Игнов — от той же основы, но без суффикса -ев. Игноев стоит особняком: его модель показывает, что прозвище было не на -а/-я, а на твёрдый согласный, что редкость для русских патронимов. Возможно, исходная форма звучала как «Игной» — и фамилия сохранила эту архаичную огласовку.