Фамилия Игупова — женская форма фамилии Игупов, а та, в свою очередь, образована от прозвища или нецерковного имени Игуп. Основа здесь — почти наверняка искажённое или диалектное произношение слова «игумен» (настоятель монастыря). В русских говорах, особенно северных и южных, встречается форма «игуп» вместо «игумен»: звук «м» переходил в «п» под влиянием простонародного выговора (ср. «комары» — «копары» в некоторых диалектах). Так что Игуп — это тот же игумен, но в народном, «опрощенном» варианте.

Такое прозвище мог получить либо сам служитель церкви, либо, что вероятнее, крестьянин или работник, находившийся в услужении при монастыре или игумене. В крестьянской среде прозвища часто давали по должности или занятию хозяина, а не самого человека: Игупом могли назвать человека за важную, степенную походку или за то, что он работал на монастырских землях. Второй, менее вероятный вариант: прозвище связано с глаголом «игупить» — в некоторых говорах это означало «гнуть, горбить», и тогда Игуп — человек сгорбленный или сутулый.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов/-ев указывает на принадлежность («чей?» — сын Игупа). Фамилия Игупов (и Игупова) встречается нечасто, географически тяготеет к южнорусским областям (Курская, Воронежская, Ростовская области), что согласуется с диалектными особенностями произношения. Однокоренные фамилии — Игумнов, Игуменов — образованы от литературной формы «игумен»; Игупов стоит особняком как более редкий, «народный» вариант.