Фамилия Икенькина — женская форма фамилии Икенькин, и в ней сразу бросается в глаза необычная основа. В русских фамилиях часто встречаются суффиксы -ин, -ов, -ский, но здесь мы имеем дело с формантом -кин, который указывает на происхождение от прозвища или имени, оканчивающегося на -ка. То есть в основе лежит слово «Икенька». Это уменьшительно-ласкательная форма от какого-то личного имени или прозвища, скорее всего, от имени Иван (Иванушка → Ика → Икенька) или от редкого канонического имени Иосиф (в народной форме Ика, Икенька). В русской диалектной традиции такие «усеченные» имена (Ика, Икша) встречались в северных и центральных губерниях, особенно в Вологодской и Архангельской областях.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная — связь с тюркскими корнями. В татарском и башкирском языках есть слово «икен» (в значении «второй»), и от него могло образоваться прозвище Икенька, которое давали второму сыну в семье. Однако в таком случае фамилия должна была бы звучать как Икенкин, а не Икенькин — мягкий знак в середине (Икень-) выдает именно русскую, уменьшительную природу слова. Скорее всего, перед нами типичная «домашняя» фамилия, образованная от обиходного имени предка.

Фамилия Икенькина очень редкая. Географически она встречается в основном в Поволжье и центральных областях России, что подтверждает версию о происхождении от русского имени, а не от тюркского прозвища. В дореволюционных метрических книгах носители фамилии фиксировались как крестьяне и мещане, без дворянских корней. Суффикс -кин указывает на принадлежность (чей сын? — Икенькин), то есть предка звали Икенька, и его дети стали Икенькиными.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями (Икин, Икшин, Иконин), то Икенькина стоит особняком из-за редкого сочетания суффиксов -еньк- и -ин-. Такая модель характерна для ласковых прозвищ, которые впоследствии закрепились как официальные фамилии. По сути, предок нынешних Икенькиных был человеком, которого в деревне звали ласково — Икенька, и это прозвище заменило ему полное имя.