Фамилия Ихочунина — редкий пример, где основа, на первый взгляд, прозрачна, но на деле скрывает несколько возможных путей происхождения. Первое, что бросается в глаза, — глагол «хотеть» в форме первого лица. Однако напрямую прозвище «Я хочу» в русской традиции почти не встречается: именования по случайной фразе или желанию скорее характерны для более поздних, искусственных фамилий или для прозвищ, данных в насмешку.

Гораздо правдоподобнее, что в основе лежит неканоническое имя или прозвище Хотун (от «хотеть» — желающий, стремящийся, возможно, жадный или, наоборот, амбициозный). Суффикс -ун в русских прозвищах активен: бегун, крикун, хотун — указывает на деятеля по характерному действию. От прозвища Хотун закономерно образовалась фамилия Хотунин (чей? — сын Хотуна). А форма Ихочунина — это уже результат диалектного или бытового переосмысления: фамилию «переразложили» на границе основы и окончания, «притянув» к фразе «я хочу». Подобные случаи, когда фамилия на -ин получает дополнительную гласную в начале, встречаются в северных и сибирских говорах, где речь более певучая и растянутая.

Есть и версия, что фамилия могла возникнуть из прозвища Ихочуня — так могли в шутку назвать капризного, своенравного или очень настойчивого человека, который постоянно повторял «я хочу». Прозвища, построенные на прямой речи («Нечей», «Пейвода»), хоть и редки, но фиксируются в русской антропонимии. В этом случае фамилия образована стандартным суффиксом -ин от прозвища Ихочуня, и никакого переразложения не было.

Женское окончание -а указывает, что перед нами форма, закрепившаяся за женщиной (вдова Ихочунина) или же фамилия, которая в современном употреблении не склоняется по мужскому роду. В любом случае, носительница фамилии Ихочунина может с высокой вероятностью считать своими предками крестьян или посадских людей из северных или центральных областей России, где фамилии на -ин от прозвищ были особенно распространены. Однозначно сказать, был ли её предок «желающим» или «капризным», невозможно, но прозвище явно выделяло его среди окружающих.