Фамилия Икинова — женская форма, а её мужской вариант Икинов. Чтобы понять происхождение, нужно разобрать основу. Скорее всего, в её основе лежит тюркское или монгольское личное имя Икин. У многих народов, от татар до калмыков, имя Ики (или Икина) означало «мать», «старшая сестра», а также могло быть формой имени, связанного с понятием «добрый», «хороший» (ср. древнетюркское edgü — «хороший»). В таком случае фамилия образована по стандартной русской модели: к основе на -а/-я прибавляется суффикс -ин, указывающий на принадлежность: «чей?» — Икинов, то есть потомок человека по имени Икина.

Есть и другая версия, менее распространённая, но правдоподобная для южных регионов. В тюркских языках слово «икин» могло означать «близнец» (ср. казахское «егіз»). Тогда прозвище Икин давали одному из близнецов, а фамилия закрепилась за его родом. Эта гипотеза объясняет, почему фамилия не очень частая: прозвище, данное по такому признаку, встречалось реже, чем имя.

Географически фамилия Икинова тяготеет к регионам с тюркским и монгольским населением: Калмыкия, Башкортостан, Татарстан, а также Астраханская область. Встречается она и у осетин, что говорит о давних контактах народов. Интересная деталь: в некоторых старых записях фамилию могли писать через «а» — Иканова, что указывает на неустойчивость произношения гласной в первом слоге. Это типично для фамилий, которые записывали со слов, а не по документам.

Разобрав суффикс, можно сказать, что фамилия Икинова — не дворянская и не искусственная (семинарская). Она из разряда «простых» патронимических фамилий, возникших в крестьянской или казачьей среде в XIX веке, когда фамилии массово давали по имени отца или по прозвищу. Предки носителей этой фамилии, скорее всего, были крестьянами или вольными поселенцами южных окраин России.