Фамилия Икушев — редкий случай, когда в основе лежит не славянское имя или прозвище, а тюркское личное имя. Её ядро — имя Икуш, которое представляет собой уменьшительную или ласкательную форму от имени Ик (или Ика). В тюркских языках, особенно в башкирском, татарском и казахском, имя Ик могло означать «двойник», «близнец», либо восходить к древнему родовому тотему. Суффикс -уш в таких именах (ср. Ильдус, Алмас) придаёт оттенок ласкательности или принадлежности, так что Икуш — это что-то вроде «маленький Ик» или «Ик из нашего рода».

Модель образования фамилии прозрачна: к основе Икуш добавили русский патронимический суффикс -ев, который в Поволжье и Приуралье с XVIII века активно присоединяли к тюркским именам при оформлении фамилий. Это типичный пример адаптации нерусского имени к русской фамильной системе: сначала человека звали Икуш, его сына записывали как Икушев («сын Икуша»), а потом фамилия закрепилась за родом.

Географически фамилия Икушев почти наверняка привязана к территории исторического расселения башкир и татар — это южный Урал, Оренбуржье, Башкортостан, а также отдельные районы Татарстана. Встречаемость фамилии крайне низкая, что говорит о её локальном происхождении: скорее всего, предок носителя был выходцем из одного конкретного села или рода, где имя Икуш было в ходу.

Искать в фамилии следы дворянского сословия или боярских родов смысла нет. Икушевы — это, вероятнее всего, потомки ясачных крестьян, башкир-вотчинников или тептярей, которые в XVIII–XIX веках получали фамилии при записи в ревизские сказки. Никакой альтернативной версии — от русского слова «икать» или от греческого корня — здесь нет и быть не может: фонетика и ареал фамилии однозначно указывают на тюркскую основу.